Campylobacteriosis in Finland: Passive Surveillance in 2004–2021 and a Pilot Case-Control Study with Whole-Genome Sequencing in Summer 2022
Julkaisuvuosi
2024
Tekijät
Suominen, Kristiina; Häkkänen, Tessa; Ranta, Jukka; Ollgren, Jukka; Kivistö, Rauni; Perko-Mäkelä, Päivikki; Salmenlinna, Saara; Rimhanen-Finne, Ruska
Tiivistelmä
Campylobacteriosis causes a significant disease burden in humans worldwide and is the most common type of zoonotic gastroenteritis in Finland. To identify infection sources for domestic Campylobacter infections, we analyzed Campylobacter case data from the Finnish Infectious Disease Register (FIDR) in 2004–2021 and outbreak data from the National Food- and Waterborne Outbreak Register (FWO Register) in 2010–2021, and conducted a pilot case-control study (256 cases and 756 controls) with source attribution and patient sample analysis using whole-genome sequencing (WGS) in July–August 2022. In the FIDR, 41% of the cases lacked information on travel history. Based on the case-control study, we estimated that of all cases, 39% were of domestic origin. Using WGS, 22 clusters of two or more cases were observed among 185 domestic cases, none of which were reported to the FWO register. Based on this case-control study and source attribution, poultry is an important source of campylobacteriosis in Finland. More extensive sampling and comparison of patient, food, animal, and environmental isolates is needed to estimate the significance of other sources. In Finland, campylobacteriosis is more often of domestic origin than FIDR notifications indicate. To identify the domestic cases, travel information should be included in the FIDR notification, and to improve outbreak detection, all domestic patient isolates should be sequenced.
Näytä enemmänOrganisaatiot ja tekijät
Julkaisutyyppi
Julkaisumuoto
Artikkeli
Emojulkaisun tyyppi
Lehti
Artikkelin tyyppi
Alkuperäisartikkeli
Yleisö
TieteellinenVertaisarvioitu
VertaisarvioituOKM:n julkaisutyyppiluokitus
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessäJulkaisukanavan tiedot
Lehti
Emojulkaisun nimi
Volyymi
12
Numero
1
Artikkelinumero
132
ISSN
Julkaisufoorumi
Julkaisufoorumitaso
1
Avoin saatavuus
Avoin saatavuus kustantajan palvelussa
Kyllä
Julkaisukanavan avoin saatavuus
Kokonaan avoin julkaisukanava
Rinnakkaistallennettu
Kyllä
Muut tiedot
Tieteenalat
Tilastotiede; Kasvibiologia, mikrobiologia, virologia; Biolääketieteet; Kansanterveystiede, ympäristö ja työterveys
Avainsanat
[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
Julkaisumaa
Sveitsi
Kustantajan kansainvälisyys
Kansainvälinen
Kieli
englanti
Kansainvälinen yhteisjulkaisu
Ei
Yhteisjulkaisu yrityksen kanssa
Kyllä
DOI
10.3390/microorganisms12010132
Julkaisu kuuluu opetus- ja kulttuuriministeriön tiedonkeruuseen
Kyllä