Conserved histidine and tyrosine determine spectral responses through the water network in Deinococcus radiodurans phytochrome
Julkaisuvuosi
2022
Tekijät
Lehtivuori, Heli; Rumfeldt, Jessica; Mustalahti, Satu; Kurkinen, Sami; Takala, Heikki
Tiivistelmä
Phytochromes are red light-sensing photoreceptor proteins that bind a bilin chromophore. Here, we investigate the role of a conserved histidine (H260) and tyrosine (Y263) in the chromophore-binding domain (CBD) of Deinococcus radiodurans phytochrome (DrBphP). Using crystallography, we show that in the H260A variant, the missing imidazole side chain leads to increased water content in the binding pocket. On the other hand, Y263F mutation reduces the water occupancy around the chromophore. Together, these changes in water coordination alter the protonation and spectroscopic properties of the biliverdin. These results pinpoint the importance of this conserved histidine and tyrosine, and the related water network, for the function and applications of phytochromes.
Näytä enemmänOrganisaatiot ja tekijät
Helsingin yliopisto
Takala Heikki
Turun yliopisto
Kurkinen Sami
Julkaisutyyppi
Julkaisumuoto
Artikkeli
Emojulkaisun tyyppi
Lehti
Artikkelin tyyppi
Alkuperäisartikkeli
Yleisö
TieteellinenVertaisarvioitu
VertaisarvioituOKM:n julkaisutyyppiluokitus
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessäJulkaisukanavan tiedot
Emojulkaisun nimi
Volyymi
21
Numero
11
Sivut
1975-1989
ISSN
Julkaisufoorumi
Julkaisufoorumitaso
1
Avoin saatavuus
Avoin saatavuus kustantajan palvelussa
Kyllä
Julkaisukanavan avoin saatavuus
Osittain avoin julkaisukanava
Rinnakkaistallennettu
Kyllä
Muut tiedot
Tieteenalat
Nanoteknologia; Biokemia, solu- ja molekyylibiologia; Biolääketieteet
Avainsanat
[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
Julkaisumaa
Yhdistynyt kuningaskunta
Kustantajan kansainvälisyys
Kansainvälinen
Kieli
englanti
Kansainvälinen yhteisjulkaisu
Ei
Yhteisjulkaisu yrityksen kanssa
Ei
DOI
10.1007/s43630-022-00272-6
Julkaisu kuuluu opetus- ja kulttuuriministeriön tiedonkeruuseen
Kyllä