undefined

Conserved histidine and tyrosine determine spectral responses through the water network in Deinococcus radiodurans phytochrome

Julkaisuvuosi

2022

Tekijät

Lehtivuori, Heli; Rumfeldt, Jessica; Mustalahti, Satu; Kurkinen, Sami; Takala, Heikki

Tiivistelmä

Phytochromes are red light-sensing photoreceptor proteins that bind a bilin chromophore. Here, we investigate the role of a conserved histidine (H260) and tyrosine (Y263) in the chromophore-binding domain (CBD) of Deinococcus radiodurans phytochrome (DrBphP). Using crystallography, we show that in the H260A variant, the missing imidazole side chain leads to increased water content in the binding pocket. On the other hand, Y263F mutation reduces the water occupancy around the chromophore. Together, these changes in water coordination alter the protonation and spectroscopic properties of the biliverdin. These results pinpoint the importance of this conserved histidine and tyrosine, and the related water network, for the function and applications of phytochromes.
Näytä enemmän

Organisaatiot ja tekijät

Helsingin yliopisto

Takala Heikki

Tampereen yliopisto

Lehtivuori Heli Orcid -palvelun logo

Jyväskylän yliopisto

Takala Heikki Orcid -palvelun logo

Lehtivuori Heli Orcid -palvelun logo

Rumfeldt Jessica Orcid -palvelun logo

Kurkinen Sami

Mustalahti Satu

Turun yliopisto

Kurkinen Sami

Julkaisutyyppi

Julkaisumuoto

Artikkeli

Emojulkaisun tyyppi

Lehti

Artikkelin tyyppi

Alkuperäisartikkeli

Yleisö

Tieteellinen

Vertaisarvioitu

Vertaisarvioitu

OKM:n julkaisutyyppiluokitus

A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Julkaisukanavan tiedot

Volyymi

21

Numero

11

Sivut

1975-1989

Julkaisu­foorumi

64984

Julkaisufoorumitaso

1

Avoin saatavuus

Avoin saatavuus kustantajan palvelussa

Kyllä

Julkaisukanavan avoin saatavuus

Osittain avoin julkaisukanava

Rinnakkaistallennettu

Kyllä

Muut tiedot

Tieteenalat

Nanoteknologia; Biokemia, solu- ja molekyylibiologia; Biolääketieteet

Avainsanat

[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]

Julkaisumaa

Yhdistynyt kuningaskunta

Kustantajan kansainvälisyys

Kansainvälinen

Kieli

englanti

Kansainvälinen yhteisjulkaisu

Ei

Yhteisjulkaisu yrityksen kanssa

Ei

DOI

10.1007/s43630-022-00272-6

Julkaisu kuuluu opetus- ja kulttuuriministeriön tiedonkeruuseen

Kyllä