undefined

Phytoplankton group identification with chemotaxonomic biomarkers : In combination they do better

Julkaisuvuosi

2023

Tekijät

Peltomaa, Elina; Asikainen, Harri; Blomster, Jaanika; Pakkainen, Hannu; Rigaud, Cyril; Salmi, Pauliina; Taipale, Sami

Tiivistelmä

Chemotaxonomic biomarkers are needed to monitor and evaluate the nutritional quality of phytoplankton communities. The biomolecules produced by different phytoplankton species do not always follow genetic phylogeny. Therefore, we analyzed fatty acids, sterols, and carotenoids from 57 freshwater phytoplankton strains to evaluate the usability of these biomolecules as chemotaxonomic biomarkers. We found 29 fatty acids, 34 sterols, and 26 carotenoids in our samples. The strains were grouped into cryptomonads, cyanobacteria, diatoms, dinoflagellates, golden algae, green algae, and raphidophytes, and the phytoplankton group explained 61%, 54%, and 89% of the variability of fatty acids, sterols, and carotenoids, respectively. Fatty acid and carotenoid profiles distinguished most phytoplankton groups, but not flawlessly. For example, fatty acids could not distinguish golden algae and cryptomonads, whereas carotenoids did not separate diatoms and golden algae. The sterol composition was heterogeneous but seemed to be useful for distinguishing different genera within a phytoplankton group. The chemotaxonomy biomarkers yielded optimal genetic phylogeny when the fatty acids, sterols, and carotenoids were used together in multivariate statistical analysis. Our results suggest that the accuracy of phytoplankton composition modeling could be enhanced by combining these three biomolecule groups.
Näytä enemmän

Organisaatiot ja tekijät

Jyväskylän yliopisto

Rigaud Cyril

Pakkanen Hannu Orcid -palvelun logo

Asikainen Harri Orcid -palvelun logo

Salmi Pauliina Orcid -palvelun logo

Taipale Sami Orcid -palvelun logo

Helsingin yliopisto

Peltomaa Elina

Blomster Jaanika

Julkaisutyyppi

Julkaisumuoto

Artikkeli

Emojulkaisun tyyppi

Lehti

Artikkelin tyyppi

Alkuperäisartikkeli

Yleisö

Tieteellinen

Vertaisarvioitu

Vertaisarvioitu

OKM:n julkaisutyyppiluokitus

A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Julkaisukanavan tiedot

Emojulkaisun nimi

Phytochemistry

Kustantaja

Elsevier

Volyymi

209

Artikkelinumero

113624

Julkaisu­foorumi

65079

Julkaisufoorumitaso

1

Avoin saatavuus

Avoin saatavuus kustantajan palvelussa

Kyllä

Julkaisukanavan avoin saatavuus

Osittain avoin julkaisukanava

Rinnakkaistallennettu

Kyllä

Muut tiedot

Tieteenalat

Ekologia, evoluutiobiologia; Biokemia, solu- ja molekyylibiologia; Kasvibiologia, mikrobiologia, virologia

Avainsanat

[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]

Julkaisumaa

Yhdistynyt kuningaskunta

Kustantajan kansainvälisyys

Kansainvälinen

Kieli

englanti

Kansainvälinen yhteisjulkaisu

Ei

Yhteisjulkaisu yrityksen kanssa

Ei

DOI

10.1016/j.phytochem.2023.113624

Julkaisu kuuluu opetus- ja kulttuuriministeriön tiedonkeruuseen

Kyllä