undefined

How to reach optimal estimates of confidence intervals in microscopic counting of phytoplankton?

Julkaisuvuosi

2021

Tekijät

Salonen, Ari Heimo Kalevi; Salmi, Pauliina; Keskitalo, Jorma

Tiivistelmä

Present practices in the microscopic counting of phytoplankton to estimate the reliability of results rely on the assumption of a random distribution of taxa in sample preparations. In contrast to that and in agreement with the literature, we show that aggregated distribution is common and can lead to over-optimistic confidence intervals, if estimated according to the shortcut procedure of Lund et al. based on the number of counted cells. We found a good linear correlation between the distribution independent confidence intervals for medians and those for parametric statistics so that 95% confidence intervals can be approximated by using a correction factor of 1.4. Instead, the recommendation to estimate confidence intervals from the total number of counted cells according to Lund et al. should be categorically rejected. We further propose the adoption of real-time confidence intervals during microscopic counting as the criterion to define how long counting should be continued. Then each sample can be counted in its individual way to reach the necessary reliability independent of highly different samples. Such a dynamic counting strategy would be the most significant development in the quality control of phytoplankton counting since the early pioneers established the present counting practices in the late 1950s.
Näytä enemmän

Organisaatiot ja tekijät

Helsingin yliopisto

Salonen Ari Heimo Kalevi

Keskitalo Jorma

Jyväskylän yliopisto

Salmi Pauliina Orcid -palvelun logo

Julkaisutyyppi

Julkaisumuoto

Artikkeli

Emojulkaisun tyyppi

Lehti

Artikkelin tyyppi

Alkuperäisartikkeli

Yleisö

Tieteellinen

Vertaisarvioitu

Vertaisarvioitu

OKM:n julkaisutyyppiluokitus

A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Julkaisukanavan tiedot

Volyymi

43

Numero

6

Sivut

846–852

Julkaisu­foorumi

61374

Julkaisufoorumitaso

1

Avoin saatavuus

Avoin saatavuus kustantajan palvelussa

Kyllä

Julkaisukanavan avoin saatavuus

Osittain avoin julkaisukanava

Kustantajan version lisenssi

CC BY

Rinnakkaistallennettu

Kyllä

Rinnakkaistallenteen lisenssi

CC BY

Muut tiedot

Tieteenalat

Tilastotiede; Ympäristötiede; Ekologia, evoluutiobiologia; Kasvibiologia, mikrobiologia, virologia

Avainsanat

[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]

Julkaisumaa

Yhdistynyt kuningaskunta

Kustantajan kansainvälisyys

Kansainvälinen

Kieli

englanti

Kansainvälinen yhteisjulkaisu

Ei

Yhteisjulkaisu yrityksen kanssa

Ei

DOI

10.1093/plankt/fbab062

Julkaisu kuuluu opetus- ja kulttuuriministeriön tiedonkeruuseen

Kyllä