Genome-wide association studies identify 137 genetic loci for DNA methylation biomarkers of aging

Kuvaus

Abstract Background Biological aging estimators derived from DNA methylation data are heritable and correlate with morbidity and mortality. Consequently, identification of genetic and environmental contributors to the variation in these measures in populations has become a major goal in the field. Results Leveraging DNA methylation and SNP data from more than 40,000 individuals, we identify 137 genome-wide significant loci, of which 113 are novel, from genome-wide association study (GWAS) meta-analyses of four epigenetic clocks and epigenetic surrogate markers for granulocyte proportions and plasminogen activator inhibitor 1 levels, respectively. We find evidence for shared genetic loci associated with the Horvath clock and expression of transcripts encoding genes linked to lipid metabolism and immune function. Notably, these loci are independent of those reported to regulate DNA methylation levels at constituent clock CpGs. A polygenic score for GrimAge acceleration showed strong associations with adiposity-related traits, educational attainment, parental longevity, and C-reactive protein levels. Conclusion This study illuminates the genetic architecture underlying epigenetic aging and its shared genetic contributions with lifestyle factors and longevity.
Näytä enemmän

Julkaisuvuosi

2021

Aineiston tyyppi

Tekijät

Mika Kähönen - Tekijä

Pashupati Mishra - Tekijä

Terho Lehtimäki - Tekijä

Tuntematon organisaatio

Adolfo Correa - Tekijä

Ake T. Lu - Tekijä

Alex P. Reiner - Tekijä

Alexandra M. Binder - Tekijä

Alicia K. Smith - Tekijä

Amit Patki - Tekijä

Andre G. Uitterlinden - Tekijä

Andrew M. McIntosh - Tekijä

Ann Zenobia Moore - Tekijä

Annette Peters - Tekijä

Ayoung Jeong - Tekijä

Beate Ritz - Tekijä

Caroline Hayward - Tekijä

Caroline L. Relton - Tekijä

Christian Gieger - Tekijä

Dale P. Sandler - Tekijä

Dan Mason - Tekijä

Daniel L. McCartney - Tekijä

David J. Porteous - Tekijä

David J. Van Den Berg - Tekijä

Deborah A. Lawlor - Tekijä

Dianjianyi Sun - Tekijä

Donna Arnett - Tekijä

Dorret I. Boomsma - Tekijä

Eco J. C. de Geus - Tekijä

Elina Sillanpää - Tekijä

Eric Boerwinkle - Tekijä

Falk W. Lohoff - Tekijä

Gail Davies - Tekijä

Gibran Hemani - Tekijä

Hannah R. Elliott - Tekijä

Hemant Tiwari - Tekijä

Ian J. Deary - Tekijä

Idil Yet - Tekijä

Jaakko Kaprio - Tekijä

Jack A. Taylor - Tekijä

Jacob K. Kresovich - Tekijä

James G. Wilson - Tekijä

James S. Pankow - Tekijä

Jeesun Jung - Tekijä

Jennifer A. Smith - Tekijä

Jenny van Dongen - Tekijä

Jerome I. Rotter - Tekijä

Jie Yao - Tekijä

Joanne M. Murabito - Tekijä

John Wright - Tekijä

Jonas Mengel-From - Tekijä

Jordana T. Bell - Tekijä

Josine L. Min - Tekijä

Joyce B. J. van Meurs - Tekijä

Kaare Christensen - Tekijä

Karen N. Conneely - Tekijä

Kathryn L. Lunetta - Tekijä

Konstantin Strauch - Tekijä

Laura M. Raffield - Tekijä

Lili Milani - Tekijä

Linda Broer - Tekijä

Luigi Ferrucci - Tekijä

Marguerite Irvin - Tekijä

Maria K. Sobczyk - Tekijä

Marianne Nygaard - Tekijä

Massimo Mangino - Tekijä

Matthijs D. van der Zee - Tekijä

Medea Imboden - Tekijä

Melanie Waldenberger - Tekijä

Melissa C. Southey - Tekijä

Mette Soerensen - Tekijä

Miina Ollikainen - Tekijä

Myriam Fornage - Tekijä

Nancy L. Pedersen - Tekijä

Nicole Probst-Hensch - Tekijä

Oliver Robinson - Tekijä

Olli Raitakari - Tekijä

Pamela R. Matias-Garcia - Tekijä

Paolo Vineis - Tekijä

Paul Elliott - Tekijä

Pei-Chien Tsai - Tekijä

Pei-Lun Kuo - Tekijä

Peter Durda - Tekijä

Pierre-Antoine Dugué - Tekijä

Rebecca C. Richmond - Tekijä

Riccardo E. Marioni - Tekijä

Roger L. Milne - Tekijä

Rosie M. Walker - Tekijä

Rui Xia - Tekijä

Sara Hägg - Tekijä

Sarah E. Harris - Tekijä

Scott M. Ratliff - Tekijä

Seyma Katrinli - Tekijä

Sharon L. R. Kardia - Tekijä

Shengxu Li - Tekijä

Silva Kasela - Tekijä

Silvia Polidoro - Tekijä

Stefania Bandinelli - Tekijä

Stephen S. Rich - Tekijä

Steve Horvath - Tekijä

Teemu Palviainen - Tekijä

Therese Tillin - Tekijä

Tom G. Richardson - Tekijä

Toshiko Tanaka - Tekijä

Wei Chen - Tekijä

Wei Zhao - Tekijä

Xiaochuan Wang - Tekijä

Xiuqing Guo - Tekijä

Yunzhang Wang - Tekijä

Zongli Xu - Tekijä

figshare - Julkaisija

Projekti

Muut tiedot

Tieteenalat

Biolääketieteet

Kieli

englanti

Saatavuus

Avoin

Lisenssi

Creative Commons Nimeä 4.0 Kansainvälinen (CC BY 4.0)

Avainsanat

Biomedicine

Asiasanat

Ajallinen kattavuus

undefined

Liittyvät aineistot