undefined

Clustered genes encoding 2-keto-L-gulonate reductase and L-idonate 5-dehydrogenase in the novel fungal D-glucuronic acid pathway

Julkaisuvuosi

2017

Tekijät

Kuivanen, Joosu; Arvas, Mikko; Richard, Peter

Abstrakti:

<p>D-Glucuronic acid is a biomass component that occurs in plant cell wall polysaccharides and is catabolized by saprotrophic microorganisms including fungi. A pathway for D-glucuronic acid catabolism in fungal microorganisms is only partly known. In the filamentous fungus Aspergillus niger, the enzymes that are known to be part of the pathway are the NADPH requiring D-glucuronic acid reductase forming L-gulonate and the NADH requiring 2-keto-L-gulonate reductase that forms L-idonate. With the aid of RNA sequencing we identified two more enzymes of the pathway. The first is a NADPH requiring 2-keto-L-gulonate reductase that forms L-idonate, GluD. The second is a NAD <sup>+</sup> requiring L-idonate 5-dehydrogenase forming 5-keto-gluconate, GluE. The genes coding for these two enzymes are clustered and share the same bidirectional promoter. The GluD is an enzyme with a strict requirement for NADP <sup>+</sup>/NADPH as cofactors. The k <sub>cat</sub> for 2-keto-L-gulonate and L-idonate is 21.4 and 1.1 s <sup>-1</sup>, and the K <sub>m</sub> 25.3 and 12.6 mM, respectively, when using the purified protein. In contrast, the GluE has a strict requirement for NAD <sup>+</sup>/NADH. The k <sub>cat</sub> for L-idonate and 5-keto-D-gluconate is 5.5 and 7.2 s <sup>-1</sup>, and the K <sub>m</sub> 30.9 and 8.4 mM, respectively. These values also refer to the purified protein. The gluD deletion resulted in accumulation of 2-keto-L-gulonate in the liquid cultivation while the gluE deletion resulted in reduced growth and cessation of the D-glucuronic acid catabolism. </p>
Näytä enemmän

Organisaatiot ja tekijät

Teknologian tutkimuskeskus VTT Oy

Kuivanen Joosu

Arvas Mikko

Richard Peter Orcid -palvelun logo

Julkaisutyyppi

Julkaisumuoto

Artikkeli

Emojulkaisun tyyppi

Lehti

Artikkelin tyyppi

Alkuperäisartikkeli:

Yleisö

Tieteellinen

Vertaisarvioitu

Vertaisarvioitu

OKM:n julkaisutyyppiluokitus

A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessä

Julkaisukanavan tiedot

Volyymi

8

Numero

FEB

Artikkelinumero

225

Julkaisu­foorumi

70489

Julkaisufoorumitaso

1

Avoin saatavuus

Avoin saatavuus kustantajan palvelussa

Kyllä

Julkaisukanavan avoin saatavuus

Kokonaan avoin julkaisukanava

Kustantajan version lisenssi

CC BY

Rinnakkaistallennettu

Ei

Avoimen saatavuuden kirjoittajamaksu €

2490

Avoimen saatavuuden kirjoittajamaksun vuosi

2017

Muut tiedot

Tieteenalat

Kasvibiologia, mikrobiologia, virologia; Biolääketieteet

Avainsanat

[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]

Kieli

englanti

Kansainvälinen yhteisjulkaisu

Ei

Yhteisjulkaisu yrityksen kanssa

Ei

DOI

10.3389/fmicb.2017.00225

Julkaisu kuuluu opetus- ja kulttuuriministeriön tiedonkeruuseen

Kyllä