Clustered genes encoding 2-keto-L-gulonate reductase and L-idonate 5-dehydrogenase in the novel fungal D-glucuronic acid pathway
Julkaisuvuosi
2017
Tekijät
Kuivanen, Joosu; Arvas, Mikko; Richard, Peter
Abstrakti:
<p>D-Glucuronic acid is a biomass component that occurs in plant cell wall polysaccharides and is catabolized by saprotrophic microorganisms including fungi. A pathway for D-glucuronic acid catabolism in fungal microorganisms is only partly known. In the filamentous fungus Aspergillus niger, the enzymes that are known to be part of the pathway are the NADPH requiring D-glucuronic acid reductase forming L-gulonate and the NADH requiring 2-keto-L-gulonate reductase that forms L-idonate. With the aid of RNA sequencing we identified two more enzymes of the pathway. The first is a NADPH requiring 2-keto-L-gulonate reductase that forms L-idonate, GluD. The second is a NAD <sup>+</sup> requiring L-idonate 5-dehydrogenase forming 5-keto-gluconate, GluE. The genes coding for these two enzymes are clustered and share the same bidirectional promoter. The GluD is an enzyme with a strict requirement for NADP <sup>+</sup>/NADPH as cofactors. The k <sub>cat</sub> for 2-keto-L-gulonate and L-idonate is 21.4 and 1.1 s <sup>-1</sup>, and the K <sub>m</sub> 25.3 and 12.6 mM, respectively, when using the purified protein. In contrast, the GluE has a strict requirement for NAD <sup>+</sup>/NADH. The k <sub>cat</sub> for L-idonate and 5-keto-D-gluconate is 5.5 and 7.2 s <sup>-1</sup>, and the K <sub>m</sub> 30.9 and 8.4 mM, respectively. These values also refer to the purified protein. The gluD deletion resulted in accumulation of 2-keto-L-gulonate in the liquid cultivation while the gluE deletion resulted in reduced growth and cessation of the D-glucuronic acid catabolism. </p>
Näytä enemmänOrganisaatiot ja tekijät
Julkaisutyyppi
Julkaisumuoto
Artikkeli
Emojulkaisun tyyppi
Lehti
Artikkelin tyyppi
Alkuperäisartikkeli:
Yleisö
TieteellinenVertaisarvioitu
VertaisarvioituOKM:n julkaisutyyppiluokitus
A1 Alkuperäisartikkeli tieteellisessä aikakauslehdessäJulkaisukanavan tiedot
Lehti/Sarja
Volyymi
8
Numero
FEB
Artikkelinumero
225
ISSN
Julkaisufoorumi
Julkaisufoorumitaso
1
Avoin saatavuus
Avoin saatavuus kustantajan palvelussa
Kyllä
Julkaisukanavan avoin saatavuus
Kokonaan avoin julkaisukanava
Kustantajan version lisenssi
CC BY
Rinnakkaistallennettu
Ei
Avoimen saatavuuden kirjoittajamaksu €
2490
Avoimen saatavuuden kirjoittajamaksun vuosi
2017
Muut tiedot
Tieteenalat
Kasvibiologia, mikrobiologia, virologia; Biolääketieteet
Avainsanat
[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object],[object Object]
Kieli
englanti
Kansainvälinen yhteisjulkaisu
Ei
Yhteisjulkaisu yrityksen kanssa
Ei
DOI
10.3389/fmicb.2017.00225
Julkaisu kuuluu opetus- ja kulttuuriministeriön tiedonkeruuseen
Kyllä