Syöpä kuuluu edelleen sairauksiin, joiden hoito on kaikkein monimutkaisinta, etenkin jos kasvaimet muuttuvat aggressiivisiksi tai hoitoresistenteiksi. Tässä projektissa kehitetään syväoppimisen ja verkostotieteen menetelmiä, joiden avulla syövän geenisäätelyverkostoja voidaan kartoittaa ennennäkemättömän tarkasti. Integroimalla erityyppistä molekyylidataa pyrimme paljastamaan, miten geenien säätelyelementtien kytkennät muuttuvat eri potilailla, eri kasvaintyypeissä ja kasvainten eri alapopulaatioissa. Laajaan julkiseen data-aineistoon ja suomalaiseen iCAN-kohorttiin sovellettujen malliemme odotetaan paljastavan piileviä syövän alatyyppejä sekä aggressiivisuuteen ja hoitoresistenssiin vaikuttavia tekijöitä. Näin ne linkittävät molekyylimekanismeja kliinisiin hoitotuloksiin ja luovat perustan verkostopohjaiselle täsmäonkologialle.

2025