Rakenteellinen virheettömyys metagenomien kokoamisessa
Rahoitetun hankkeen kuvaus
Sekvensointidatan määrä on kasvanut valtavasti viimeisen vuosikymmenen aikana. Jotta tätä dataa voitaisiin analysoida tehokkaasti, se täytyy koota genomeiksi tai esittää kompaktisti. Nykyiset työkalut, jotka kokoavat genomeja tai esittävät sekvensointidatan kompaktisti, tuottavat vain joukon sekvenssejä ilman arvioita sekvenssien oikeellisuudesta, mikä vaikeuttaa jatkoanalyysien oikeellisuuden arviointia. Me kehitämme malleja, jotka arvioivat koottujen sekvenssien oikeellisuutta. Me tuotamme näiden sekvenssien jokaiselle alimerkkijonolle arvion siitä todennäköisyydestä, että kyseinen alimerkkijono esiintyy sekvensoidussa näytteessä. Me tarkastelemme yhden genomin tai useamman genomin sekoituksen kokoamista ja sekvensointidatan kompaktia esittämistä. Menetelmiemme ansiosta on mahdollista analysoida tarkasti genomisten analyysien oikeellisuutta ja kohdistaa validointia koottujen sekvenssien epävarmoille alueille.
Näytä enemmänAloitusvuosi
2025
Päättymisvuosi
2029
Myönnetty rahoitus
Rahoittaja
Suomen Akatemia
Rahoitusmuoto
Akatemiahanke
Päättäjä
Luonnontieteiden ja tekniikan tutkimuksen toimikunta
12.06.2025
12.06.2025
Muut tiedot
Rahoituspäätöksen numero
370538
Tieteenalat
Biolääketieteet
Tutkimusalat
Systeemibiologia, bioinformatiikka
Tunnistetut aiheet
genes, genetics