Proteomiikkadata tehokkaaseen käyttöön tekoälyn ja suurteholaskennan avulla

Akronyymi

AI.MS

Rahoitetun hankkeen kuvaus

Hankkeemme hyödyntää EuroHPC:n suurteholaskentaresursseja proteomiikka-aineistojen analyysin edistämiseksi edistyneiden tekoälymenetelmien avulla. Hanke on yhteistyö Turun ja Coloradon yliopistojen, ELIXIR Suomen ja EMBL-EBI:n välillä. Tavoitteemme on luoda massaspektrometriaan perustuvalle proteomiikalle suurteholaskenta-alusta, jonka avulla voimme parantaa suurten datamäärien tulkintaa ja tehokasta käsittelyä tekoälyalgoritmien ja GPU-laskennan avulla FAIR- periaatteita ja globaaleja datastandardeja noudattaen. Laajan sovellettavuuden ja luotettavuuden varmistamiseksi testaamme toimintaa sekä keinotekoisesti luoduissa että erilaisissa reaalimaailman koeasetelmissa keskittyen erityisesti varhaisten tautimarkkereiden tunnistamiseen. Tieteellisen ymmärryksen lisäksi tavoittemme on parantaa tiedeyhteisön osaamista suurteholaskennassa, kansainvälisessä datan yhteentoimivuudessa sekä julkisten proteomiikka-aineistojen uudelleenkäyttössä ja tukea näin biolääketieteen digitaalista siirtymää.
Näytä enemmän

Aloitusvuosi

2025

Päättymisvuosi

2027

Myönnetty rahoitus


Laura Elo Orcid -palvelun logo
487 878 €

Rooli Suomen Akatemian konsortiossa

Johtaja

Muut osapuolet

Partneri
CSC - Tieteen tietotekniikan keskus Oy (364899)
106 384 €

Rahoittaja

Suomen Akatemia

Rahoitusmuoto

Suunnattu akatemiahanke

Päättäjä

Suomen akatemian muu päättäjä
18.12.2024

Muut tiedot

Rahoituspäätöksen numero

364700

Tieteenalat

Tietojenkäsittely ja informaatiotieteet

Tutkimusalat

Laskennallinen tiede