Proteomiikkadata tehokkaaseen käyttöön tekoälyn ja suurteholaskennan avulla
Akronyymi
AI.MS
Rahoitetun hankkeen kuvaus
Hankkeemme hyödyntää EuroHPC:n suurteholaskentaresursseja proteomiikka-aineistojen analyysin edistämiseksi edistyneiden tekoälymenetelmien avulla. Hanke on yhteistyö Turun ja Coloradon yliopistojen, ELIXIR Suomen ja EMBL-EBI:n välillä. Tavoitteemme on luoda massaspektrometriaan perustuvalle proteomiikalle suurteholaskenta-alusta, jonka avulla voimme parantaa suurten datamäärien tulkintaa ja tehokasta käsittelyä tekoälyalgoritmien ja GPU-laskennan avulla FAIR- periaatteita ja globaaleja datastandardeja noudattaen. Laajan sovellettavuuden ja luotettavuuden varmistamiseksi testaamme toimintaa sekä keinotekoisesti luoduissa että erilaisissa reaalimaailman koeasetelmissa keskittyen erityisesti varhaisten tautimarkkereiden tunnistamiseen. Tieteellisen ymmärryksen lisäksi tavoittemme on parantaa tiedeyhteisön osaamista suurteholaskennassa, kansainvälisessä datan yhteentoimivuudessa sekä julkisten proteomiikka-aineistojen uudelleenkäyttössä ja tukea näin biolääketieteen digitaalista siirtymää.
Näytä enemmänAloitusvuosi
2025
Päättymisvuosi
2027
Myönnetty rahoitus
Rooli Suomen Akatemian konsortiossa
Johtaja
Muut osapuolet
Rahoittaja
Suomen Akatemia
Rahoitusmuoto
Suunnattu akatemiahanke
Päättäjä
Suomen akatemian muu päättäjä
18.12.2024
18.12.2024
Muut tiedot
Rahoituspäätöksen numero
364700
Tieteenalat
Tietojenkäsittely ja informaatiotieteet
Tutkimusalat
Laskennallinen tiede