Hankkeemme hyödyntää EuroHPC:n suurteholaskentaresursseja proteomiikka-aineistojen analyysin edistämiseksi edistyneiden tekoälymenetelmien avulla. Hanke on yhteistyö Turun ja Coloradon yliopistojen, ELIXIR Suomen ja EMBL-EBI:n välillä. Tavoitteemme on luoda massaspektrometriaan perustuvalle proteomiikalle suurteholaskenta-alusta, jonka avulla voimme parantaa suurten datamäärien tulkintaa ja tehokasta käsittelyä tekoälyalgoritmien ja GPU-laskennan avulla FAIR- periaatteita ja globaaleja datastandardeja noudattaen. Laajan sovellettavuuden ja luotettavuuden varmistamiseksi testaamme toimintaa sekä keinotekoisesti luoduissa että erilaisissa reaalimaailman koeasetelmissa keskittyen erityisesti varhaisten tautimarkkereiden tunnistamiseen. Tieteellisen ymmärryksen lisäksi tavoittemme on parantaa tiedeyhteisön osaamista suurteholaskennassa, kansainvälisessä datan yhteentoimivuudessa sekä julkisten proteomiikka-aineistojen uudelleenkäyttössä ja tukea näin biolääketieteen digitaalista siirtymää.

2025

2027