Hankkeessa kehitetään bioinformaattisia työkaluja ja koneoppimista virusten tunnistamiseen ja karakterisointiin. Perinteiset menetelmät eivät aina tunnista uusia tai harvinaisia viruksia sekvenssitiedon puuttuessa. Hyödynnämme aiemmin kehitettämiämme menetelmiä, joilla voidaan lukea ja analysoida näytteiden nukleiinihapot ja tunnistaa virusperimät ilman ennakko-oletuksia myös tuntemattomista viruksista. Kehitämme metagenomiikan analyysimenetelmiä ja intuitiivista käyttöliittymää kliinisten ja ympäristönäytteiden tutkimiseen sekä virusten rakenteen ja toiminnan muutosten ennustamista sekvenssidatasta. Tavoitteena on nopea ja luotettava analyysimenetelmä uusien ja epätyypillisten viruspatogeenien tunnistamiseen, mikä edistäisi myös kontrollitoimia.

2024