MiWaGen

Jätevesiseuranta on noussut uudeksi epidemiatyökaluksi tartuntatautien seurannassa, koska sen avulla voidaan havaita väestötasolla tapahtuvia muutoksia. Uuden sukupolven sekvensointitekniikoiden nopea kehittyminen on laskenut sekvensoinnin kustannuksia, mikä puolestaan tukee projekteja, joissa tutkitaan näytteen koko geneettinen materiaali (metagenomit). Tässä hankkeessa tutkimme jäteveden metagenomia, jonka avulla saamme luotettavan kuvan väestön terveyteen vaikuttavista tekijöistä viemäriverkoston alueella. Arvioimme jäteveden geneettisten tekijöiden ja paikkakuntakohtaisten terveystietojen välisiä tilastollisia riippuvuuksia. Käytämme näiden geneettisten tautiriski-indikaattorien tunnistamiseen bioinformatiikan ja datatieteen menetelmiä, esimerkiksi koneoppimista. Lisäksi tutkimus tuottaa kustannustehokkaan menetelmän infektioepidemiologisen terveystiedon tuottamiselle ja väestön terveystutkimukselle.

2023

2027