Vaihtoehtoisella liitoksella on osoitettu olevan tärkeä rooli syövän kehityksessä. Tällä hetkellä useimmat vaihtoehtoiset silmukointitutkimukset pysyvät irtotavarana RNA-seq-tasolla. Vaikka arvioidaan, että 92% ihmisen geeneistä käy läpi vaihtoehtoisen silmukoinnin, irtotavarana RNA-seq: tä käyttävät tutkimukset voivat paljastaa vaihtoehtoisen silmukoinnin vain pienelle osalle syövän geeneistä. Tämä johtuu syövän heterogeenisestä luonteesta, jossa merkittävät silmukointitapahtumat ovat spesifisiä solupopulaatiolle keskiarvona kaikille heterogeenisille soluille. Siksi on luonnollista turvautua yksisoluiseen RNA-sekvensointiin (scRNA-sekvenssi) syövän heterogeenisyyden käsittelemiseksi. Tässä projektissa aion käyttää multi-omics-lähestymistapaa systemaattisesti tutkimaan vaihtoehtoista silmukointia ja sen säätelyä syövän scRNA-sekvenssin perusteella.

2020

2025