NanoBaseLib: A Multi-Task Benchmark Dataset for Nanopore Sequencing
Kuvaus
NanoBaseLib is a multi-task benchmark dataset for Nanopore Sequencing. We compile and preprocess publicly available datasets using a unified pipeline to ensure consistency and quality across all tasks. The dataset is benchmarked for four key Nanopore sequencing tasks: base calling, polyA detection, segmentation and event alignment, and RNA modification detection. NanoBaseLib is available at https://nanobaselib.github.io.
Näytä enemmänJulkaisuvuosi
2024
Aineiston tyyppi
Tekijät
University of Eastern Finland - Muu tekijä
Zenodo - Julkaisija
Projekti
Muut tiedot
Tieteenalat
Tietojenkäsittely ja informaatiotieteet
Kieli
Saatavuus
Avoin