NanoBaseLib: A Multi-Task Benchmark Dataset for Nanopore Sequencing

Kuvaus

NanoBaseLib is a multi-task benchmark dataset for Nanopore Sequencing. We compile and preprocess publicly available datasets using a unified pipeline to ensure consistency and quality across all tasks. The dataset is benchmarked for four key Nanopore sequencing tasks: base calling, polyA detection, segmentation and event alignment, and RNA modification detection. NanoBaseLib is available at https://nanobaselib.github.io.
Näytä enemmän

Julkaisuvuosi

2024

Aineiston tyyppi

Tekijät

Department of Computer Science

Chengbo Fu - Tekijä

Guangzhao Cheng Orcid -palvelun logo - Tekijä

Lu Cheng Orcid -palvelun logo - Tekijä

University of Eastern Finland - Muu tekijä

Zenodo - Julkaisija

Projekti

Muut tiedot

Tieteenalat

Tietojenkäsittely ja informaatiotieteet

Kieli

Saatavuus

Avoin

Lisenssi

Creative Commons Nimeä 4.0 Kansainvälinen (CC BY 4.0)

Avainsanat

Asiasanat

Ajallinen kattavuus

undefined

Liittyvät aineistot