MD simulation trajectory and related files for POPC bilayer with 30 mol% of protonated pazePC (Berger, Gromacs 4.5.)

Kuvaus

Simulation trajectory and related files for POPC bilayer with 30mol% of pazePC in deprotonated form used in "Acyl chain disorder and azelaoyl orientation in lipid membranes containing oxidised lipids" by T. M. Ferreira, et al., to be submitted. The simulation with deprotonated pazePC from the same publication available at http://dx.doi.org/10.5281/zenodo.44622 90 POPC, 38 pazePC, 7250 water and 38 potassium molecules. Simulation time 120ns. Force field for POPC is based on Berger model and force field for pazePC is modified from H. Khandelia and O. G. Mouritsen, Biophysical Journal, 2009, 96(7), 2734 – 2743, http://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2009.01.007.
Näytä enemmän

Julkaisuvuosi

2016

Aineiston tyyppi

Tekijät

Department of Neuroscience and Biomedical Engineering

Samuli Ollila - Tekijä

Zenodo - Julkaisija

Projekti

Muut tiedot

Tieteenalat

Biokemia, solu- ja molekyylibiologia

Kieli

Saatavuus

Avoin

Lisenssi

Creative Commons Yleismaailmallinen (CC0 1.0) Public Domain lausuma

Avainsanat

Asiasanat

Ajallinen kattavuus

undefined

Liittyvät aineistot