Test data for the Glutton software

Kuvaus

Glutton is a novel tool to process transcriptome assemblies for downstream evolutionary analyses. Glutton takes as input a set of fragmented, possibly erroneous transcriptome assemblies. Utilising phylogeny-aware alignment and reference data from a closely related species, it reconstructs one transcript per gene, finds orthologous sequences and produces accurate multiple alignments of coding sequences. The method is described in a preprint at https://www.biorxiv.org/content/10.1101/077511v1. This is the test data for the method.
Näytä enemmän

Julkaisuvuosi

2023

Aineiston tyyppi

Tekijät

Biotekniikan instituutti

Ari Löytynoja - Tekijä, Julkaisija

Projekti

Muut tiedot

Tieteenalat

Tietojenkäsittely ja informaatiotieteet; Ekologia, evoluutiobiologia

Kieli

Saatavuus

Avoin

Lisenssi

Creative Commons Nimeä 4.0 Kansainvälinen (CC BY 4.0)

Avainsanat

evolutionary analysis, transcriptome assembly

Asiasanat

Ajallinen kattavuus

undefined

Liittyvät aineistot