Bio-logger Ethogram Benchmark: A benchmark for computational analysis of animal behavior, using animal-borne tags

Kuvaus

This repository contains the datasets presented in our forthcoming work: B. Hoffman, M. Cusimano, V. Baglione, D. Canestrari, D. Chevallier, D. DeSantis, L. Jeantet, M. Ladds, T. Maekawa, V. Mata-Silva, V. Moreno-González, A. Pagano, E. Trapote, O. Vainio, A. Vehkaoja, K. Yoda, K. Zacarian, A. Friedlaender, and C. Rutz, "A benchmark for computational analysis of animal behavior, using animal-borne tags," 2023. It also contains the experiment results which are reported in the paper. Standardized code to implement, train, and evaluate models can be found at https://github.com/earthspecies/BEBE/. Please note the licenses in each dataset folder. Zip folders beginning with "formatted": These are the datasets we used to run the experiments reported in the benchmark paper. Zip folders beginning with "raw": These are the unprocessed datasets used in BEBE. Code to processing a these raw datasets into the format used by BEBE can be found at https://github.com/earthspecies/BEBE-datasets/. Zip folders beginning with "experiments": Results of the cross-validation experiments reported in the paper, as well as hyperparameter optimization and cross-validation runs. Confusion matrices for all experiments can also be found here.
Näytä enemmän

Julkaisuvuosi

2023

Aineiston tyyppi

Tekijät

Antti Vehkaoja - Tekijä

Tuntematon organisaatio

Ari Friedlaender - Tekijä

Benjamin Hoffman - Tekijä

Christian Rutz - Tekijä

Damien Chevallier - Tekijä

Daniela Canestrari - Tekijä

Dominic L. DeSantis - Tekijä

Eva Trapote - Tekijä

Katherine Zacarian - Tekijä

Ken Yoda - Tekijä

Lorène Jeantet - Tekijä

Maddie Cusimano - Tekijä

Monique A. Ladds - Tekijä

Outi Vainio - Tekijä

Takuya Maekawa - Tekijä

Vicente Mata-Silva - Tekijä

Vittorio Baglione - Tekijä

Víctor Moreno-Gonzalez - Tekijä

Zenodo - Julkaisija

Projekti

Muut tiedot

Tieteenalat

Lääketieteen bioteknologia

Kieli

englanti

Saatavuus

Avoin

Lisenssi

Creative Commons Nimeä 4.0 Kansainvälinen (CC BY 4.0)

Avainsanat

Medical biotechnology

Asiasanat

Ajallinen kattavuus

undefined

Liittyvät aineistot