Rasvamaksan biomarkkeriaineisto hankkeesta Identification of gut-derived factors responsible for exercise-induced reward, physical inactivity and obesity
Kuvaus
The study aimed at finding gut microbiota signatures and metabolite markers in plasma and feces related to high liver fat content in humans. Based on imaging, we divided study participants into low (<5%, LF, n=25) and high (>5%, HF, n=39) liver fat groups. Fecal (LF n=14, HF n=25) and plasma (LF n=11, HF n=7) metabolomes of subsets of participants were studied using liquid chromatography/high resolution mass spectrometry. The gut microbiota were analyzed using 16S rRNA gene sequencing. Additionally, blood clinical variables, body composition and diet were studied.
The list of metadata variables can be found below. They are categorized by the type of sample and/or analysis.
BLOOD CLINICAL VARIABLES & UNITS
alanine aminotransferase, ALT (U/L)
aspartate aminotransferase, AST (U/L)
gamma-glutamyltransferase, GGT(U/L)
total cholesterol (mmol/L)
high-density lipoprotein, HDL (mmol/L)
low-density lipoprotein, LDL (mmol/L)
triglycrides (mmol/L)
glucose (mmol/L)
insulin (iU/L)
HOMA-IR
BODY COMPOSITION VARIABLES & UNITS
Height (cm)
Weight (kg)
body mass index, BMI (kg/m2)
Waist circumference (cm)
blood pressure (BP) systolic (mm Hg)
blood pressure (BP) diastolic (mm Hg)
Liver fat %
GUT MICROBIOTA COMPOSITION
fastq files of the sequences
OUT counts per each sample
relative abundance per each sample
diversity measures (Shannon, Chao1, phylogenetic diversity, Bray Curtis distance)
METABOLITES
plasma metabolites & identification information
fecal metabolites & identification information
DIETARY INTAKES & UNITS (from 3 different days & average from 3 days)
Energy (kJ)
Energy (kcal)
Protein (g)
Carbohydrates (g)
Fat (g)
Alcohol
Coffee (dl/3 days) *
Fatty acids (g)
Monosaturated Fatty acids (g)
Polyunsaturated Fatty acids (g)
Sucrose (g)
Fiber, total (g)
Vitamin C (mg)
Thiamine (B1) (mg)
Vitamin E (mg)
Vitamin A (µg)
Vitamin D (µg)
Riboflavin (B2) (mg)
Vitamin K (mg)
Vitamin B6 (mg)
Folate (B9) (µg)
Sodium (mg)
Magnesium (mg)
Calcium (mg)
Potassium (mg)
Iron (mg)
Iodine (µg)
Phosphorus (mg)
Selenium (µg)
Zinc (mg)
Fatty acids, total (g)
Cholesterol (mg)
Fatty acids, trans (g)
Lactose (g)
Fiber, total amount (g)
Vitamin B12 (cobalamine) (µg)
Salt (mg)
Omega-6 Fatty acids (g)
Omega-3 Fatty acids (g).
Näytä enemmänJulkaisuvuosi
2023
Aineiston tyyppi
Tekijät
Helsingin ja Uudenmaan sairaanhoitopiiri - Muu tekijä
Helsingin yliopisto - Muu tekijä
Itä-Suomen yliopisto - Muu tekijä
Jyväskylän yliopisto - Muu tekijä, Julkaisija
Liikuntatieteellinen tiedekunta
Hintikka, Jukka - Tekijä
Mäkinen, Elina - Tekijä
Terveystieteiden laitos
Pekkala, Satu - Tekijä, Oikeuksienhaltija
Tuntematon
Pietiläinen, Kirsi H. - Muu tekijä, Tekijä
Hakkarainen, Antti - Tekijä
Juvonen, Risto - Tekijä
Keski-Rahkonen, Pekka - Tekijä
Kuula, Juho - Tekijä
Laukkanen, Jari A. - Tekijä
Lehtonen, Marko - Tekijä
O’Connell, Thomas - Tekijä
Projekti
Muut tiedot
Tieteenalat
Oikeuslääketiede ja muut lääketieteet
Kieli
englanti
Saatavuus
Saatavuutta rajoitettu