Rasvamaksan biomarkkeriaineisto hankkeesta Identification of gut-derived factors responsible for exercise-induced reward, physical inactivity and obesity

Kuvaus

The study aimed at finding gut microbiota signatures and metabolite markers in plasma and feces related to high liver fat content in humans. Based on imaging, we divided study participants into low (<5%, LF, n=25) and high (>5%, HF, n=39) liver fat groups. Fecal (LF n=14, HF n=25) and plasma (LF n=11, HF n=7) metabolomes of subsets of participants were studied using liquid chromatography/high resolution mass spectrometry. The gut microbiota were analyzed using 16S rRNA gene sequencing. Additionally, blood clinical variables, body composition and diet were studied. The list of metadata variables can be found below. They are categorized by the type of sample and/or analysis. BLOOD CLINICAL VARIABLES & UNITS alanine aminotransferase, ALT (U/L) aspartate aminotransferase, AST (U/L) gamma-glutamyltransferase, GGT(U/L) total cholesterol (mmol/L) high-density lipoprotein, HDL (mmol/L) low-density lipoprotein, LDL (mmol/L) triglycrides (mmol/L) glucose (mmol/L) insulin (iU/L) HOMA-IR BODY COMPOSITION VARIABLES & UNITS Height (cm) Weight (kg) body mass index, BMI (kg/m2) Waist circumference (cm) blood pressure (BP) systolic (mm Hg) blood pressure (BP) diastolic (mm Hg) Liver fat % GUT MICROBIOTA COMPOSITION fastq files of the sequences OUT counts per each sample relative abundance per each sample diversity measures (Shannon, Chao1, phylogenetic diversity, Bray Curtis distance) METABOLITES plasma metabolites & identification information fecal metabolites & identification information DIETARY INTAKES & UNITS (from 3 different days & average from 3 days) Energy (kJ) Energy (kcal) Protein (g) Carbohydrates (g) Fat (g) Alcohol Coffee (dl/3 days) * Fatty acids (g) Monosaturated Fatty acids (g) Polyunsaturated Fatty acids (g) Sucrose (g) Fiber, total (g) Vitamin C (mg) Thiamine (B1) (mg) Vitamin E (mg) Vitamin A (µg) Vitamin D (µg) Riboflavin (B2) (mg) Vitamin K (mg) Vitamin B6 (mg) Folate (B9) (µg) Sodium (mg) Magnesium (mg) Calcium (mg) Potassium (mg) Iron (mg) Iodine (µg) Phosphorus (mg) Selenium (µg) Zinc (mg) Fatty acids, total (g) Cholesterol (mg) Fatty acids, trans (g) Lactose (g) Fiber, total amount (g) Vitamin B12 (cobalamine) (µg) Salt (mg) Omega-6 Fatty acids (g) Omega-3 Fatty acids (g).
Näytä enemmän

Julkaisuvuosi

2023

Aineiston tyyppi

Tekijät

Helsingin ja Uudenmaan sairaanhoitopiiri - Muu tekijä

Helsingin yliopisto - Muu tekijä
Itä-Suomen yliopisto - Muu tekijä
Jyväskylän yliopisto - Julkaisija, Muu tekijä

Terveystieteiden laitos

Pekkala, Satu - Oikeuksienhaltija, Tekijä

Psykologian laitos

Lensu, Sanna Orcid -palvelun logo - Tekijä

Liikuntatieteellinen tiedekunta

Hintikka, Jukka - Tekijä

Mäkinen, Elina - Tekijä

Tuntematon

Pietiläinen, Kirsi H. - Muu tekijä, Tekijä

Hakkarainen, Antti - Tekijä

Juvonen, Risto - Tekijä

Keski-Rahkonen, Pekka - Tekijä

Kuula, Juho - Tekijä

Laukkanen, Jari A. - Tekijä

Lehtonen, Marko - Tekijä

O’Connell, Thomas - Tekijä

Projekti

Muut tiedot

Tieteenalat

Oikeuslääketiede ja muut lääketieteet

Kieli

englanti

Saatavuus

Saatavuutta rajoitettu

Lisenssi

Muu (Ei avoin)

Avainsanat

Asiasanat

aineenvaihdunta (biologiset ilmiöt), insuliiniresistenssi, mikrobiologia, rasvamaksa

Ajallinen kattavuus

undefined

Liittyvät aineistot