MD simulation trajectory and related files for POPC bilayer with 30 mol% of deprotonated pazePC (Berger, Gromacs 4.5.)
Kuvaus
Simulation trajectory and related files for POPC bilayer with 30mol% of pazePC in deprotonated form used in "Acyl chain disorder and azelaoyl orientation in lipid membranes containing oxidised lipids" by T. M. Ferreira, et al., to be submitted.
90 POPC, 38 pazePC, 7250 water and 38 potassium molecules. Simulation time 120ns.
Force field for POPC is based on Berger model and force field for pazePC is from H. Khandelia and O. G. Mouritsen, Biophysical Journal, 2009, 96(7), 2734 – 2743, http://dx.doi.org/10.1016/j.bpj.2009.01.007.
If used, please cite approriate publications.
Näytä enemmänJulkaisuvuosi
2016
Aineiston tyyppi
Tekijät
Department of Neuroscience and Biomedical Engineering
Himanshu Khandelia - Tekijä
Samuli Ollila - Tekijä
SDU-Denmark - Muu tekijä
Zenodo - Julkaisija
Projekti
Muut tiedot
Tieteenalat
Biokemia, solu- ja molekyylibiologia
Kieli
Saatavuus
Avoin