Andersson et al, 2024, transcriptomic and epigenomic data

Kuvaus

This repository contains raw and processed data described in Andersson et al. (2024) and pertaining to following three experiments: 1) RNA-seq of Dm-aKG treated intestinal stem cells (ISCs) and controls 2) Enzymatic 5hmC-seq of Dm-aKG treated ISCs and controls 3) whole-genome oxidative bisulfite sequencing of ISC^Old-mitochondria, ISC^Young-mitochondria, transit amplifying cells, and Paneth cells. For additional information on data sets, see "Andersson_README.txt" located at the root directory.
Näytä enemmän

Julkaisuvuosi

2024

Aineiston tyyppi

Tekijät

Biotekniikan instituutti

Arto Viitanen Orcid -palvelun logo - Tekijä, Julkaisija

Pekka Katajisto Orcid -palvelun logo - Oikeuksienhaltija

Simon Andersson Orcid -palvelun logo - Muu tekijä

Projekti

Muut tiedot

Tieteenalat

Biokemia, solu- ja molekyylibiologia; Genetiikka, kehitysbiologia, fysiologia

Kieli

englanti

Saatavuus

Avoin

Lisenssi

Creative Commons Nimeä 4.0 Kansainvälinen (CC BY 4.0)

Avainsanat

mitochondria, aKG supplementation, Intestinal stem cell, Methylation, Mouse intestine

Asiasanat

transkriptomi, DNA-metylaatio, mitokondriot, suolisto

Ajallinen kattavuus

undefined

Liittyvät aineistot