Skramblaasit ovat proteiineja, jotka mahdollistavat lipidien liikkeen solun kalvojen puoliskojen välillä. Niiden rakennetta ja toimintamekanismeja on tutkittu viime aikoina kiivaasti, mutta useat tutkimuskysymykset ovat toistaiseksi vailla vastausta. Tässä projektissa etsimme vielä löytämättömiä skramblaaseja sekä selvitämme, miten kalvoympäristö vaikuttaa skramblaasien aktiivisuuteen. Kehitämme myös uudenlaisen pH-aktivoitavan skramblaasin, jonka pohjalta suunnittelemme lääkekuljetukseen sopivien vesikkelien esiasteita. Työssämme käytetään korkean suorituskyvyn molekyylidynamiikkasimulaatioita, jotka mahdollistavat skramblaasien toiminnan tutkimisen samanaikaisesti tuhansissa eri kalvoympäristöissä. Koneoppimisen avulla etsimme kerätystä datasta niin kaikkia skramblaaseja koskevia lainalaisuuksia, kuin myös tietoa yksittäisten skramblaasien valikoivuudesta toimintaympäristönsä suhteen. Tuloksemme validioidaan kansainvälisen tutkimusyhteistyöverkoston toimesta laboratoriokokein.

2026

2030