Skramblaasiproteiinit mahdollistavat lipidien liikkeen solun kalvojen puoliskojen välillä. Niiden rakennetta ja toimintamekanismeja on tutkittu viime aikoina kiivaasti, mutta useat tutkimuskysymykset ovat toistaiseksi vailla vastausta. Tässä projektissa etsimme vielä löytämättömiä skramblaaseja sekä selvitämme, miten kalvoympäristö vaikuttaa skramblaasien aktiivisuuteen. Pyrimme myös kehittämään pH-aktivoitavan skramblaasin, jota hyödynnämme lääkekuljetukseen sopivien partikkelien suunnittelussa. Työssämme käytetään korkean suorituskyvyn molekyylidynamiikkasimulaatioita, jotka mahdollistavat skramblaasien toiminnan tutkimisen samanaikaisesti useissa eri kalvoympäristöissä. Koneoppimisen avulla etsimme kerätystä datasta niin kaikkia skramblaaseja koskevia lainalaisuuksia, kuin myös tietoa yksittäisten skramblaasien valikoivuudesta toimintaympäristönsä suhteen. Tuloksemme validioidaan kansainvälisen tutkimusyhteistyöverkoston toimesta käyttäen erilaisia laboratoriokokeita.

2026

2030