Todennäköisyyspohjainen syväoppiminen hoitovasteen ennustamiseen käyttämällä yksisolumittauksia

Rahoitetun hankkeen kuvaus

Yksisoluiset sekvensointitekniikat (esim. scRNA-seq) ovat muuttaneet yksilöllistä lääketiedettä tarjoamalla korkean resoluution biomarkkereita diagnostiikkaan, eloonjäämisanalyysiin ja hoitovasteen ennustamiseen. scRNA-seq-teknologian sovellettavuus tilastolliseen hoitovasteanalyysiin on kuitenkin rajoitettu scRNA-seq aineistojen erityispiirteiden vuoksi. Tässä projektissa kehitämme näihin tehtäviin todennäköisyysperusteisia syväoppimismenetelmiä. Testaamme ja validoimme menetelmämme laajasti käyttäen erilaisia yksisolumittausaineistoja, mukaan lukien scRNA-seq mittauksia immunoterapioilla hoidetuista syöpäpotilaista.
Näytä enemmän

Aloitusvuosi

2026

Päättymisvuosi

2029

Myönnetty rahoitus

Harri Lähdesmäki
512 745 €

Rahoittaja

Suomen Akatemia

Rahoitusmuoto

Akatemiahanke

Päättäjä

Biotieteiden, terveyden ja ympäristön tutkimuksen toimikunta
16.06.2025

Muut tiedot

Rahoituspäätöksen numero

371998

Tieteenalat

Biolääketieteet

Tutkimusalat

Systeemibiologia, bioinformatiikka

Tunnistetut aiheet

bioinformatics