Kokonaisvaltaisen menetelmän kehittäminen maaperän orvakkamaisten kantasienten monimuotoisuuden tutkimukseen

Rahoitetun hankkeen kuvaus

Viimeisen kahden vuosikymmenen aikana kymmeniä tuhansia sienilajeja on havaittu maaperänäytteistä DNA-sekvenssejä analysoimalla. Suuri osa näistä lajeista tunnetaan vain tästä DNA-aineistosta. Tämä on haaste perinteiselle sienitieteelle, joka perustuu sieninäytteisiin. Hankkeen tavoite on kuroa umpeen tätä aukkoa sieninäytteiden ja maaperän DNA-sekvenssien välillä. Keskitymme kolmeen kantasienilahkoon (Agaricales, Atractiellales ja Trechisporales) ja näissä lahkoissa runsaslukuisina edustettuihin orvakoihin eli sieniin, joiden itiöemät ovat pinnanmyötäisiä ja sileitä. Hanke yhdistää kaksi tutkimusmenetelmää: 1) laajamittainen sieninäytteiden DNA-sekvensointi ja yhdistäminen vain maaperänäytteistä tunnettuihin sekvensseihin; 2) orvakoiden itiöemien kerääminen maaperäaineiston paljastamista lajistokeskittymistä, sekä tämän aineiston analyysi mikroskoopin ja DNA-sekvensoinnin keinoin. Tuottamamme tieto laajentaa merkittävästi ymmärrystämme orvakoiden elintavoista ja maaperäeliöstöstä.
Näytä enemmän

Aloitusvuosi

2024

Päättymisvuosi

2028

Myönnetty rahoitus

Viacheslav Spirin Orcid -palvelun logo
517 865 €

Rahoittaja

Suomen Akatemia

Rahoitusmuoto

Akatemiatutkijan tehtävä

Päättäjä

Biotieteiden, terveyden ja ympäristön tutkimuksen toimikunta
12.06.2024

Muut tiedot

Rahoituspäätöksen numero

364105

Tieteenalat

Kasvibiologia, mikrobiologia, virologia

Tutkimusalat

Kasvibiologia