Aptameerit ovat lyhyitä RNA- tai DNA-sekvenssejä, jotka sitoutuvat kohdeproteiineihinsa hyvällä affiniteetilla ja spesifisesti. Perinteisesti aptameerit seulotaan SELEX-menetelmällä, joka on työläs ja jonka tulokset ovat satunnaisia. Haluamme tässä tutkimuksessa rationaalistaa aptameerien suunnittelua laskennallisten menetelmien avulla. Käyttämällä aptameerin ja kohdeproteiinin 3D-rakennetta voimme optimoida sitoutumisvuorovaikutukset ja testata kokeellisesti vain lupaavimmat aptameerit. Tämä menetelmä voi mullistaa aptameerien suunnittelun tekemällä siitä helpompaa, rationaalisempaa ja halvempaa.

2024

2026