Läpinäkyvä proteiinitoimintojen ennustaminen käyttäen alialueoptimointia ja uusia piirrejoukkoja
Rahoitetun hankkeen kuvaus
Biotieteet käyttävät suuria sekvensointihankkeita nykyisten globaalien haasteiden - ilmastonmuutokseen sopeutumisen, kasvavan ihmispopulaation ruokkimisen, uusien patogeenien torjumise, jne. - tutkimiseen. Tuotetut valtavat sekvenssiaineistot on liitettävä biologisiin toimintoihin ennen käyttöä. Sekvenssiaineistoja suuren koon vuoksi niitä ei voi tulkita manuaalisesti. Tämä on tehnyt automaattisesta proteiinitoimintojen ennustamisesta (AFP) tärkeän ja aktiivisen tutkimusaiheen. Projektimme soveltaa huippuluokan koneoppimista AFP-menetelmiin ja käyttää innovatiivisia lähestymistapoja opetusaineiston niukkuuden ja laadun haasteiden ratkaisemiseksi. Konkreettisena tuloksena parannettu AFP-menetelmä asennetaan verkkopalvelimelle, joka on vapaasti biotieteilijöiden käytettävissä ympäri maailmaa. Parannetulla AFP-menetelmällämme odotetaan olevan maailmanlaajuista vaikuttavuutta, aivan kuten nykyisillä menetelmillämme, joita käytetään laajasti ratkaisemaan alussa mainittuja haasteita.
Näytä enemmänAloitusvuosi
2023
Päättymisvuosi
2026
Myönnetty rahoitus
Rahoittaja
Suomen Akatemia
Rahoitusmuoto
Akatemiahanke
Haku
Päättäjä
Luonnontieteiden ja tekniikan tutkimuksen toimikunta
06.06.2023
06.06.2023
Muut tiedot
Rahoituspäätöksen numero
357350
Tieteenalat
Biolääketieteet
Tutkimusalat
Systeemibiologia, bioinformatiikka
Tunnistetut aiheet
molecular biology, biochemistry