Tulevaisuuden menetelmät yhdysvaikutusgeeniryppäiden löytämiseen dynaamisia geeniverkkoja analysoitaessa

Rahoitetun hankkeen kuvaus

Tässä projektissa pyritään kehittämään uusia tilastomatematiikan menetelmiä monessa mielessä realististisempien verkkorakenteiden arvioimiseen biologisesta mittausdatasta. Biologiselle mittausdatalle tyypillistä on arvioitavan geeniverkon suuri koko ja mitattavien yksilöiden pieni määrä. Tämä on haasteellinen lähtökohta verkkojen arviointitehtäville. Mittaukset on tehty peräkkäisinä aikapisteissä joille kullekin arvioidaan tilastollisilla menetelmillä oma verkkorakenne siten että verkkorakenteen arviointiin käytettävää informaatiota pyritään hyödyntämään viereisten aikapisteiden kesken. Yhtenä tavoitteena hankkeessa on saada jatkuvissa fenotyyppimittauksissa oleva informaatio paremmin sisällytettyä osaksi geeniverkon arvioimistehtävää ja siten kertomaan oleellista tietoa geenien toiminnallisesta yhteydestä fenotyyppiin. Projektissa kehitettävillä menetelmillä tulee olemaan paljon sovelluksia biologian ja lääketieteen tutkimuskentässä.
Näytä enemmän

Aloitusvuosi

2023

Päättymisvuosi

2026

Myönnetty rahoitus

Mikko Sillanpää Orcid -palvelun logo
493 848 €

Rahoittaja

Suomen Akatemia

Rahoitusmuoto

Akatemiahanke

Muut tiedot

Rahoituspäätöksen numero

349393

Tieteenalat

Tilastotiede

Tutkimusalat

Tilastotiede

Tunnistetut aiheet

computer science, information science, algorithms