DNA-sekvensoinnin nopea kehitys on avannut täysin uusia tutkimusmahdollisuuksia mikrobiekologian alalla. Vaikka esimerkiksi luonnollisissa ympäristöissä esiintyvien mikrobiyhteisöjen rakennetta, ekologisia tehtäviä ja dynamiikkaa voidaan mitata aiempaa tarkemmin, mittausten luotettava tulkinta vaatii pitkälle erikoistuneita tilastomenetelmiä, jotka osaavat huomioida aineistojen erityislaadun. Tässä hankkeessa kehitetään tilastollinen yhtenäismalli, joka mahdollistaa mikrobiekosysteemien perustavanlaatuisten prosessien - tulkinnan valinnan, ajautumisen, levittäytymisen, ja lajiutumisen syvemmän kuvaamisen. Mallin avulla tutkimme ja vertaamme erilaisissa luonnollisissa ympäristöissä esiintyviä mikrobiyhteisöjä, joihin sisältyvät ihmisen ja villien lintukantojen suolistomikrobisto sekä valtamerten mikrobiyhteisöt. Hankkeessa kehitettävä yhtenäismalli luo uusia tutkimusmenetelmiä, joiden avulla voidaan tutkia mikrobiston yhteyksistä esimerkiksi terveyteen, biodiversiteettiin, ja ilmastoon.

2021

2024