DNA-viivakoodauksen hyödyntäminen automaattisessa lajitunnistuksessa

Rahoitetun hankkeen kuvaus

DNA-viivakoodauksen hyödyntäminen automaattisessa lajitunnistuksessa –projekti pyrkii yhdistämään DNA-viivakoodauksen ja kuviin perustuvan koneoppisen uudella tavalla automaattisen vesistöjen biomonitoroinnin edistämiseksi. Projektissa optimoimme lajitunnistusta kokonaisuutena, joka sisältää kuvantamis-, viivakoodaus- ja koneoppimisvaiheita, ja kehitämme uusia koneoppimisalgoritmeja kokonaisuutta edistävällä tavalla keskittyen kolmeen päätehtävään: 1) koulutusaineistoon kuuluvien lajien tunnistus, 2) koulutusaineistoon kuulumattomien lajien havaitseminen ja 3) biomassan automaattinen arviointi. Kaikissa näissä tehtävissä pyrimme hyödyntämään viivakoodaustuloksia uusin tavoin. Projektin aikana keräämme uuden suuren tutkimusta tukevan tietokannan. Tutkimus tehdään Suomen ympäristökeskuksessa, mikä mahdollistaa tulosten hyödyntäminen suoraan käytännön biologisessa seurannassa ja sitä kautta ympäristöön liittyvässä päätöksenteossa.
Näytä enemmän

Aloitusvuosi

2020

Päättymisvuosi

2024

Myönnetty rahoitus

Jenni Raitoharju Orcid -palvelun logo
317 454 €

Rahoittaja

Suomen Akatemia

Rahoitusmuoto

Akatemiahanke

Muut tiedot

Rahoituspäätöksen numero

333497

Tieteenalat

Tietojenkäsittely ja informaatiotieteet

Tutkimusalat

Laskennallinen data-analyysi

Tunnistetut aiheet

bioinformatics