DNA-viivakoodauksen hyödyntäminen automaattisessa lajitunnistuksessa
Rahoitetun hankkeen kuvaus
DNA-viivakoodauksen hyödyntäminen automaattisessa lajitunnistuksessa –projekti pyrkii yhdistämään DNA-viivakoodauksen ja kuviin perustuvan koneoppisen uudella tavalla automaattisen vesistöjen biomonitoroinnin edistämiseksi. Projektissa optimoimme lajitunnistusta kokonaisuutena, joka sisältää kuvantamis-, viivakoodaus- ja koneoppimisvaiheita, ja kehitämme uusia koneoppimisalgoritmeja kokonaisuutta edistävällä tavalla keskittyen kolmeen päätehtävään: 1) koulutusaineistoon kuuluvien lajien tunnistus, 2) koulutusaineistoon kuulumattomien lajien havaitseminen ja 3) biomassan automaattinen arviointi. Kaikissa näissä tehtävissä pyrimme hyödyntämään viivakoodaustuloksia uusin tavoin. Projektin aikana keräämme uuden suuren tutkimusta tukevan tietokannan. Tutkimus tehdään Suomen ympäristökeskuksessa, mikä mahdollistaa tulosten hyödyntäminen suoraan käytännön biologisessa seurannassa ja sitä kautta ympäristöön liittyvässä päätöksenteossa.
Näytä enemmänAloitusvuosi
2020
Päättymisvuosi
2024
Myönnetty rahoitus
Muut tiedot
Rahoituspäätöksen numero
333497
Tieteenalat
Tietojenkäsittely ja informaatiotieteet
Tutkimusalat
Laskennallinen data-analyysi
Tunnistetut aiheet
bioinformatics