Bakteerit ovat sosiaalisia olentoja, jotka elävät tiiviissä yhteisöissä ja ovat jatkuvasti monipuolisessa vuorovaikutuksessa naapuriensa kanssa. Bakteeriyhteisöiden avaruudellinen rakenne on monimutkainen ja heijastelee eri bakteeriryhmien keskinäisiä vuorovaikutuksia. Tämä rakenne vaikuttaa keskeisesti siihen, miten geneettinen materiaali - mukaanlukien antibioottiresistenssigeenit - leviää bakteeriyhteisöissä. Tässä tutkimussuunnitelmassa hyödynnän uuden sukupolven DNA-sekvensointia ja yksisolugenomiikkaa sen selvittämiseksi, mitkä bakteerien vuorovaikutukset erityisesti vaikuttavat yhteisöiden avaruudelliseen rakenteeseen sekä miten nämä rakenteet vaikuttavat resistenssigeenien leviämiseen.

2020

2026