Combining StarDist and TrackMate example 1 - Breast cancer cell dataset

Kuvaus

Description: Contains a StarDist example training dataset, a test dataset, and the StarDist model generated using ZeroCostDL4Mic (see https://github.com/HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic/wiki/Stardist) Training dataset: 72 Paired microscopy images (fluorescence) and corresponding masks Microscopy data type: Fluorescence microscopy (SiR-DNA) and masks obtained via manual segmentation (see https://github.com/HenriquesLab/ZeroCostDL4Mic/wiki/Stardist for details about the segmentation) Microscope: Spinning disk confocal microscope with a 20x 0.8 NA objective Cell type: DCIS.COM Lifeact-RFP cells File format: .tif (16-bit for fluorescence and 8 and 16-bit for the masks) Image size: 1024x1024 (Pixel size: 634 nm)
Näytä enemmän

Julkaisuvuosi

2020

Aineiston tyyppi

Tekijät

Zenodo - Julkaisija

Guillaume Jacquemet Orcid -palvelun logo - Tekijä

Projekti

Muut tiedot

Tieteenalat

Biokemia, solu- ja molekyylibiologia

Kieli

Saatavuus

Avoin

Lisenssi

Creative Commons Nimeä 4.0 Kansainvälinen (CC BY 4.0)

Avainsanat

Asiasanat

Ajallinen kattavuus

undefined

Liittyvät aineistot